Složení mitochondriální matrix

V prostoru mezi kristami se nachází amorfní matrix, která je bohatá na bílkoviny, s obsahem malého množstvím DNA a RNA. Mitochondriální DNA je dvojřetězcová a má kruhovitou strukturu. Řetězce mitochondriální DNA jsou syntetizovány v mitochonriích a proto replikace těchto organel nezávisí na jaderné DNA. Mitochondriální RNA existuje ve třech typech: ribosomální (rRNA), informační (mRNA) a transportní (tRNA). V mitochondriích tedy dochází k syntéze proteinů, avšak vzhledem k nízkému obsahu DNA je většina proteinů kódována jadernou DNA a syntetizována v cytoplazmě buňky. Z ní jsou pak proteiny transportovány do mitochondrií, doposud neobjasněným způsobem.