V mikrobiologii je nedílnou součástí stanovení počtu mikrobiálních buněk v určitém prostředí (např. při kontrole biotechnologických procesů, při hledání optimálních růstových podmínek pro určitý kmen mikroorganizmů, při analytickém stanovení vitaminů, aminokyselin nebo jiných sloučenin, při sledování účinnosti dezinfekčních nebo konzervačních prostředků nebo při zjišťování mikroorganizmů v potravinářských surovinách a hotových výrobcích, ve vodě a vzduchu). V potravinářství je stanovení počtu mikroorganizmů velmi důležité, neboť nás informuje o kvalitě surovin i hotových výrobků a o jejich údržnosti. Sledováním počtu mikrobů, případně i jejich druhů, se můžeme také přesvědčit o vhodnosti technologických postupů, o bezpečnosti sterilačních zákroků a také o sanitačních a hygienických podmínkách na daném úseky výroby nebo distribuce.